可能也会有一些麻烦,那你们现在因为对于自免来说,你也要有你的相当于自免这一块相关的一个数据库这个相关的一个,还有就是算法,这方面的经验能不能给大家分享
许大强
自免
数据库
2022-12-13
那个就是你刚刚才 common 我非常非常赞同,就是 AI 确实是个,这个工具谁都可以用,小白也可以用,大咖也可以用对吧?其实用起来的效果也不完全一样。对小白应用得到小白可以应得的结果,大咖应用大咖得到的结果。其实最后做药还是要一定的经验,就是你同样的工具,你可以做出来美轮美奂的一个家具。然后另外一个人可能就连个板凳看上去都不像个样对吧?所以还是就是我觉得它是非常有用,但是看你怎么用,这是我对那个 AI 的看法。
今天我一到那个前面,你有个问题说是咱们跟人家的差距有多大?其实我觉得这个都应该是我们 AI 这个领域,应该是我们起步并不比人家晚太多,就是说还是就是 AI 的基础基本算法。除掉程涛博士,他是从那个姚班出身,倒是 MIT 一直在搞这一套,就是可能自己去创新一些,就是技术。大多数我发现这个 AI 工具,它的底层算法那个框架还都是不是我们这个生物医药这个领域人发现的,我们都是在人家的基础之上进行一些修修补补,改动一些东西。这是我的那个就是一个也算是一个激励。
另外再是你提到那个就是数据,其实数据今天是所有人都面临的问题,没有一家可以称自己的数据很够很多,因为这个你 AI 技术,你这个你是数据越多,它你那个模型可能会越,模型才会越准确。你我们跟那个就是自然语言识别,还有这个图像识别,这个那个数据是没法比的,人家那个互联网,也在他那个什么数据,那我们这个数据才几个对吧?所以这是一个数据量是严重不足,你要靠我们就是说公司去收集,不管是大公司,小公司,这都是有限。有人说大的公司它的优势就是数据量多,它这多也只是比如说一个数量级的多,但一个数量级的多还是远远不够硬,就是说怎么其实在我们这个领域是怎么能够去把尽量用这个仅有的就是有限的数据,能够得到一个就是还可用的一个模型,我觉得这是我们要掌握的。比如说你现在小样本学习,迁移学习这个什么,那主动学习,这都是不同的方法解决这个样本量不足的一些问题。
我特别是觉得那个就是用主动学习的方法能够快速的,就是我不需要收集,比如说他能够给我指出来哪些数据,哪些领域我可以我需要补足一些数据,不需要收集什么上千上亿这样的数据。然后这这可能就要几十个几百个,我就能得到一个比较可以合用的一个模型。还有就是我们因为还有一点就是我觉得我们经常会忽略掉,我们毕竟是科学,化学,生物,物理,有很多有些数据可以通过基就是那个原理基本计算得到,这样可以弥补我们在实验数据上面的一些不足。
这个东西比那个很多一些,就是经验公式,或者是最那个基础的写那个就是quantum-mechanics calculation ,其实算的数据都挺还挺准的。就是特别是我们现在比如说我们现在做建那个就是那个 tissuse activity 这个模型,那数据量很小的,你就几千个样本,然后可能几万条一一两万条数据,它文献让我们就找了好多些文献,那你就必须要自己产生数据,产生数据你要看看,根据你分析看哪些数据可能对你这个参数可能最有用,就是它的最重要。然后你去就收集有针对性的计算或者收集这些数据,这是我们一个方法。我们不是说有海量的什么数据库1,数据库2,数据库 3 ,那个可能大多数没有用,而是针对我们所需要,然后去产生一些数据。
但这些创新思路我们怎么样?在哪些点上,具体哪些点上,我们是通过 AI 来解决来实现差异化。另外 AI 在这里面的一个价值到底是什么样的一个?给大家聊聊是不是相当于能比人更有是不会能避免掉,能不能把best in class或者各种各样的是不是更有助于还是怎么个情况。
许大强
AI新药开发
AI技术
2022-12-13
好吧。像刚才那个程涛也提到,就是其实是程涛还是裴老师,就是说 AI 可以是把我们就是能做的更好,人工不能做的,也希望能够帮助做解决对吧。所以我们现在就是有几块,就是就是从这严重性肠炎这个项目来说,有几块我们在用一些 AI 的工具。那个就是我们病人分层这一块,我们是借助于我们的合作伙伴来实现。但是我们现在一个项目是一个双靶点的一个协同作用,一个项目。
这个项目我们是需要知道这两个靶点它的关联度是一个什么样的关联度,它是一个 Synergetic的,就是协同还是edijust还是一个什么样的关联度,这个是通过一个就是其实biosystematic上面的一个 AI 技术进行事先的一些就是预判在这个靶点的发现的过程当中,因为这是双靶点,所以这个双靶点。我们也知道就是单靶点,你给我一个口袋,然后我通过高通量筛选发现一些 motives 然后就可以进行是分子设计,这是药化他们做的最成功的地方。但你要给要拿一个双靶点,就是就是说我要有一个配体,能够同时满足一个双两个口袋的的话,就有时候就是对一个人的大脑来说,我们都还是非常线性思维化,那可能就是困难比较大一些。而对机器学习来说,他就无所谓了,给他一个靶点,两个靶点,三个靶点对它来说就是限制性条件多一些而已。所以这个就是人工智能就显示它的优越性。
既然我们有几个就是从分子发现这块,我们有就是各种方法其实都在用。我们有一个多靶点筛选的一个平台,这个就是帮助我们可以很快的发现这些靶点,就是可以对这个两个靶点同时可以作用,其实这是多靶点筛选平台,它不单纯是知道我这找一个小分子可以对两个靶点同时起作用。它又可以就说,找一个分子对一个靶点特别有,它如果你要是两个结构比较相近的靶点的话,它对一个靶点特别有效果。对于另外一个靶点,我不要它抑制,所以我就要最大限度的差异化。这两个就找一个 legan 对这两个靶点它的之间的那个亲和力差异最大的一个也行。所以这个其实是个,这是两方面都可以实现这两个目标。
我们这个项目是希望一个靶点能够同时结合两个靶点,就是说两个亲和力同时要高,就是有有没通过虚拟筛选,就是这个多靶点筛选平台,然后经过这个完了以后,再重新对接一下,就其实是相当于验证一下,我们这个到底筛出来的东西靠不靠谱。最后再加上自由能计算,再加上我们药化专家的那个,就是也肉眼去看一看对吧。然后最后这确立了差不多几十个分子去合成,差不多有一半这样的分子怎么合成出来的?都是活性相当好的,就是所以还是一个非常有用的一个工具。就是差不多是这样一个流程。就是说这 AI ,其实在早期的就是 target association 还有这下边的分子的发现都是都是充分利用起来了。
并且我们也是因为我们是不想就是做一个传统意义上的,就是就是这个 biotech先要研发这样的形式,我还是想在方法论上面有所突破,他们也是特别强调,就不论什么靶点,即使我们药化专家很厉害,我们还是希望就是能够最大限度地应用我们的就是技术平台,AI技术平台来帮助我们设计,帮助我们筛选。
从疾病类型上看癌肿的靶点,潜力
杨勇
肿瘤药
抗肿瘤
疾病靶点
2022-12-13
好的,那么这个打标签,我觉得从两个方面。第一个是肿瘤本身,它是这个高度的抑制性。那么这个世界瘤的靶点,它的这个有的比如说 gpc3 ,有人讲50%,有人讲60%。那么没有一个靶点,而是这个每个种类细分都表达的。那么另外一个,我们在这个CAR-T治疗的过程中,我们也发现针对代码点的CAR-T,它会下调这个肿瘤细胞上面的这抗原,因为肿瘤细胞它也很狡猾,它看到你来攻击它了,它能把你的把这个抗原低表达这个那我们这个时候溶瘤病毒就起作用了,它让你强制性表达,它这个让你这个藏无可藏无处逃生上可以被CAR-T抓到攻击。他比如说我们这个现在已经发现了 vgf RV 这个靶它是个脑胶质瘤的这么一个特性的,那么在CAR-T治疗的时候,它就会这个特性的下调,逃避这个CAR-T的免疫。那么还有另外就是这个 gpc3刚刚讲到的,那么截肢肠癌我们还在尝试,那么这是针对目前种类抑制性。此外我们还在考虑就是说可以把这个溶瘤病毒当成一个免疫佐剂,可以诱发内源性的抗指标的免疫应答。尤其是结束抗癌,那么 5% 的这个微型不稳定了,它才敏感。那么一我们就称为是冷肿,其实这里面免疫细胞相对比较少,现在我们还发现可能不仅仅是单纯的免疫细胞的问题。我们现在最近的研究就包括国际上也在研究就是三级淋巴结构,三级淋巴结构的存在可能与这个抗阻力免疫密切相关。因此我们在当时我最近的一阵在攻克这个问题,就是说现在发现有三级淋巴结构的肿瘤,就是对做免疫治疗敏感,而不是说单纯的有几个免疫细胞在没有用了。那几个单纯的 T 细胞, B 细胞起不了什么气候,发挥不了什么作用。那么只有三级淋巴结构,我把它比成一个航空母舰,这上面很有 T 细胞 B 细胞,有这个 IPC 细胞,还有其他的一些这个辅助滤泡的辅助的细胞。那么最强的航空母舰,既有这个能加油跟飞机加油,又提供导弹,还有鱼雷,还有这个海滨陆战队可以起飞,就多病毒作战。这个三级淋巴结构就好比这么一个结构。那么我最近正在尝试就哪些因素决定了这个有三级淋巴结构,哪些因素决定没有三级淋巴结构?我们通过熔断病毒能不能把没三级淋巴结构的那这块大,可能还需要大量的这个技术研究,有大量的技术研究在这个知识。那么然后通过溶瘤病毒,真正的把人准备变成这种这个不是简单的这个打标签的事情,不是讲打标签的事情。
溶瘤病毒的选择,与常见病毒的对比
杨勇
溶瘤病毒
常见病毒
2022-12-13
前面刘博他抓到了这个单纯疱症病毒1和 2 分别都在做这个肿瘤病毒,1已经做成了,这个数据这个值也是在美国FDA批了。那么我们严老师的抓到了M1 ,那么也是一个全新的病毒。这个需要很多年的积累,对吧?还有一个比较好的这么一个很 lucky 的这么一个运气,那找到这么一个在这个肿瘤里面对吧?低表达这某个蛋白,然后它能够溶瘤正常的细胞,表达这个蛋白它就不会这个复制或者是破坏,那这个就实现了肿瘤的选择性。那么从目前来看,这个国际上市的四款这个溶瘤病毒产品包括了这个最早的拉多维亚的,在 2004 年上市的埃克病,还有我们中国其实在 2005 年已经上市了一款腺病毒,针对图景部分 anker 那我们大家都应该知道,很早的这个它是基于腺病毒来改造的。那么这个安进和第一三共都是这个单纯疱症病毒,那么来这个研发的。那么从现在的溶瘤病毒的这个种类也有很多,包括了腺病毒、牛痘病毒、新城疫病毒、疱症病毒、湖山湖病毒和柯萨奇病毒。这些品种非常多,有的是双链 DNA 病毒,有的是单链RNA病毒,其实它们都有各自的这个优点。那么针对于这个选哪一种病毒,我想可能还要和咱们的本身的现有的这个技术管线我要实现什么目的?比如说这个我要去装很多的这个基因进去,刚刚这个我们刘总讲各装五个六个,把它作为生活反应器,那可能要载量大一点对吧,像这种病毒才能去实现那么DNA病毒是个比较好的选择。那么小RNA病毒它这个操作比较基因操作比较困难。那么在这个这个以天然病毒的为主,它的这个复制周期比较短,扩散能力比较强。当然它也有个优点,它可以有部分可以实现这个静脉注射实现静脉注射。比如说这个湖山湖病毒这个在美国就已经在研发这个经脉给药的这么一个目前好像已经在二级临床了。那么单纯疱症病毒腺病毒这些DNA病毒基因操作比较成熟,临床经验比较丰富,可能大部分 75% 以上的这个溶瘤病毒的项目可能都是在这个采用的单纯疱症病毒和腺病毒。那么DNA病毒往往复制周期比较长,扩散能力也相对比较弱,机体内的普遍存在预存抗体,预存免疫,那么这一个就可以带来全身系统给药的带来一些困难。有大部分的这个腺病毒进去以后可能60%,有人讲百分之八十九十很多人都存在着就都感染过这个下面包括我们普通感冒,很多都是腺病毒感染,那么这些可能会被预存抗体的大部分给破坏了,所以会影响到我们这个腺病毒到达肿瘤部位这个病毒的力度这个所以可能这一类的病毒现在目前还是采用瘤内给药。那么瘤内给药的这个缺点也显而易见,需要专门的医生介入个医生。来操作。也有可能在操作过程中穿刺以后可以破坏肿瘤的屏障导致肿瘤转移这个也是我们很多临床医生所担心的。因此从病毒的选择来看,静脉全身给药是一个大的趋势,也是个挑战。瘤内注射是当前的现状。那么对于这个全身给药的这个策略,目前包括了这个病毒改造,包括利用这个生物生物材料来改造或者是用一些无机材料。比如说硅,氧化硅将这些来包裹溶这个溶瘤。那么这些都有很多的研究。后面我们这个专家也可以这个再聊一聊这个话题。我大概就是说根据不同的目的选择不同的病毒。种类很多,但是可用的可能也就那么几种。现在大家都聚焦在腺病毒这个单独疱症病毒。我们杨老师的这个M1其实是很具有特点的,与众不同的也具有自主知识产权的。
注册开发的难度,怎么验证创新性病毒
颜光美
创新型病毒
2022-12-13
对,注射剂这个事情是一个非常有意思的问题。所以我们这个完全是病毒所特有的这么一个结构。我们前年的时候和浙江大学合作,我们用那个什么冷冻电竞已经解析了 m1 的 4.7i 的这个立体结构。那么从它的立体结构看起来的时候,它的这个什么它的包膜蛋白和它的脂质双层之间的那个什么那个结构力学是有很有意思。这个通过计算发现它这种病毒的膜结构它具有很好的弹性。所以这就是为什么它可以搓干,然后再可以互溶,它不会破裂。像有的病毒你把它冻干粉冻干之后,你再把它这个互溶的话,它这个什么它可能这个破裂掉,只剩下千分之一了。所以这是这也不是我们有特别高的什么这个技术水平,这是病毒属他自己就特有的那么一种特性,只是我们利用了这种特性对吧,我只是或者说我们明白了这种特性。所以在这个整个的过程研究过程中间,实际上并没有碰到他那里困难。也就是我们当时就爆出一个我就直接去做这个冻干粉。冻干粉一做了以后,大家都知道病毒一旦做成冻干粉,它就很稳定了对吧?这就加了这个溶瘤机制以后,它的这个活性保持100%,根本就没有什么破裂什么事情。所以只有在它的含水量国家标准要低于3%。当时因为我们广东这个气候的问题,就是当时第一把没有做到3%,现在没有问题了。现在这个买了一个很好的机器德国出的,可以保证你这个冻干粉做起来是达标的。所以说在做这个静脉注射剂和冻干粉的过程中间对基本上没有太大的这个什么这个技术上的难度,关键是当时你决心,你选择是对的,那么后面的路就是对的了。所以这是关于这个什么。关于我们的这个研发过程总结的这个情况。这个出现环境,我刚才介绍了这个有效性的问题,我们通过两个,第一个也就是他们刚才已经讲到了就是通过转化的原来病毒,就是把它做一个基因载体,然后就是在里面加不同的基因进去,加抗体是非常在行业里面是非常公认的,比如说加个PD1加个PDL1对吧,我们也加过他的什么纳米抗体,抗体我们都加过对吧。这里面还有一个我们加固体的一些细胞因子,所以就是通过武装化人类病毒来提高它的有效性。这是另外一个的话,就是通过小分子药的合用提高有效性。第三个的话就通过和细胞免疫治疗的方法,这个合用这是我们增加它的有效性的时候,大致上加起来就这么三种主要的思路,就是武装化的改造优化。然后就是小分子的联用。第三个就是细胞治疗的联用。就是我们大组赞就这么几个大的思路。
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