从您刚才的数据,mRNA是不是只能用AI设计?毕竟凭大脑、经验很难去计算
谢志
mRNA
2023-02-24
设计有两种思路,一种是根据已有的知识特征来改造,我们刚才说的新冠疫苗例子就是这样。第二种设计是从数据里面去发现特征,这种是数据驱动的,而第一种是经验驱动的。第二种例子就是AlphaFold 2,我们不知道一级结构有哪些特征决定了三级结构,但是当你有足够的数据来训练之后,它可以把一级结构给你预测到三级结构,所以两种可能性都是有的。
所以mRNA的设计也不一定要用AI,但是随着你的高质量数据的累积,有可能在某个程度达到量变的过程。类似之前的AlphaFold 2和现在的chat gpt一样,当你训练到一定程度的时候,它就能够找到一种高度复杂的我们人的认知看不到的特征。
你们的XOC与XDC的DAR值对比,linker方面又有什么区别?
张雪峰
DAR
XOC
XDC药物
2023-02-24
我们现在做的核酸偶联XOC的分子和ADC确实是有不同的,XOC的“X”就是代表着不同的载体形式,可以是抗体等等,这个时候我们的DAR值应该怎么选取?其实现在数据还不多,这不是有明确答案的问题,是我们领域的企业要探索的问题。DAR值不仅和载体有关,而且还和payload有关,我能想到的是一个带电核的siRNA和一个不带电核的PMO,最后你会发现不同的DAR值才能达到最优的药效。
linker方面,我们作为一个新型的药物形式,肯定是要在已有的技术上进一步的发展,我们一开始肯定会参考ADC的linker,以它们为起点。但是我们现在的经验和数据都表明,不能简单的拿来就直接用,中间是有很多待探索的东西。
RNA三级结构是不是在碱基配对后形成,单独的序列会不会不能形成?
任艾明
RNA
2023-02-24
首先我研究的RNA,它其实是相对比较保守的RNA结构域。 RNA的三级结构其实是由很多二级结构单元组成的,而在核酸里面二级结构单元定义是跟它不同形式的配对形成的具有不同特征的结构域。如果一点都不配对,形成的三级结构我觉得也是不稳定的。因为对于核酸的结构来说,你无论看哪一个核酸结构,连续堆积作用对它整体结构的稳定性是非常重要的。它形成的配对不是我们常规意义上所说的两个简单的GC、IT,有时候会形成三碱基、四碱基,甚至多碱基的配对,并且作用方式也不是仅限于碱基,它的磷酸基团同样会参与形成这多碱基的相互作用层。
你们研发的国内首个核酸偶联药物(X-Oligo Conjugates),它是通过哪种偶联方式?
张雪峰
核酸偶联药物
2023-02-24
现在的偶联方式主要还是通过化学的手段,你可以设计一个linker,两边通过不同的化学把载体和payload偶联在一起。因为payload不像传统ADC的小分子毒素,它是一个Oligo,不管从大小还是从理化性质方面都有它自己独特的性质,所以不能简单地采取像以前ADC类似的偶联化学和偶联方式,这方面有很多需要我们去探索的空间和技术。
什么是核开关?
任艾明
核开关
2023-02-24
核开关是调控辅酶类相关的合成酶或者上下代谢的酶,这些酶就会提高小分子的浓度,或者降低它的浓度,形成一个稳态的反馈机制。核开关是RNA结构域,它可以结合小分子或者一些特定配体,比如金属离子或者阴离子都是可以结合的。
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