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如果再去做蛋白质的一个模拟,我们的差异化的点,我们还能不能找到差异化点?

新药项目
王波 2022-12-08
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牛张明
您问的问题非常专业,我可能从最后一个问题先简单说一下,其实药物研发这个整个的流程和周期都非常非常长。然后 alphaFold它开源的那一部分,其实只是在非常上游的一部分,传统上是结构生物学家在做的,然后使用冷冻电镜或者 Xray 来解析,然后但是刚才我们说的这样,我先梳理一下,其实人体里面有很多基因,然后像韩老师这边它会做药物,基因比如说有 RNA、DNA 的一些表达,然后可以在最上游,也就说其实我们刚才说的小分子跟大分子的药物其实是在基因的下游,然后RNA、DNA表达出来以后这些潜在的蛋白,比如说我们传统上说的一些靶向的口服药物或注射性的药物,是作用在这个层面上,然后所以alphaFold two刚才我们说的它做的一个蛋白的预测,它是通过这个蛋白的一个序列,它可以通过序列然后来去预测出蛋白的一个三维的结构。
 
所以其实那个刚才您问的是蛋白动态模拟,动态模拟这个其实它不是 alphaFold 2所擅长的,alphaFold two它其实只擅长去预测出来,就根据序列它能比较准确地预测出某一些或一个准确而稳定的一个结构。但其实我刚才想说刚才您问的那个蛋白动态模拟,因为蛋白在人体内是那个不断的在动态的变化的。比如说它在不同的器官在不同的组织温度和PH值下面它其实状态是不一样的。然后我们刚才说的 alphaFold 2它只能预测出来其中的某一些或某一个比较稳定的一个结构,但是这个稳定的结构,它就像比如说我们在看一个两个小时的电影里面,然后截出来了一个瞬间一样,它像一个照片,这个照片往往不具有一些成效性或者不具有一些亲和力,很难找到一些比较好的口袋,所以其实 alphaFold 2 就是它开源的这部分是比如说对冷冻电镜一起解析加预测比较有帮助,但是其实它只是在药研发领域里面的一个上游环节,它其实开源了以后对我们整个产业是一个非常大的助力,但不是说它开源了以后就直接能做出药来。因为其实这个药物研发过程是非常漫长的,我们就算知道了这个结构,然后还要说至少要花个 10 年的时间用传统的流程,然后才能把这个药通过比如说它的一些成药性活性亲和力,然后再上临床一二三期,所以其实做出来药物的难度是非常大的,只说alphaFold 2它可以在上游给我们提供更多的选择,让我们对靶点和靶点的结构有一个更好的理解。
 

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