对于一个特别原创性的新靶点或者潜在性靶点,可能我知道这个靶点跟某一疾病有关,但是没有经过临床POC的验证,现在也没有任何的小分子药物报道过,那我能不能用AI 的技术来发现一些很新的先导化合物?

靶点
靳洪涛 2023-12-08
分享
邓亚峰
78
其实这里面是分情况的,一个是你的靶点有没有晶体结构,这个是比较重要。如果有晶体结构,其实没有任何问题,因为无论是分子生成还是对接,只要基于晶体结构,都是可以做一个计算的。还有一种情况,可能没有晶体结构,可能只有序列,目前传统地对接方法或者生成方法是比较难做的,即使做了可能也不是很准。但是最近DeepMind做了一个工作,它实际上是可以把蛋白序列作为输入,把小分子的结构作为输入,之后它就可以预测出来它俩相互作用的这种状态,所以我自己觉得如果这个技术成熟的话,这种只要有序列相应地做药物筛选就可以做得比较好。
 
还有另外一个,对我个人来讲,因为我们自己也在做一些靶点的选型,其实新靶点除了找一个好的苗头,我觉得可能更重要其实是生物机制,就是当你做一个全新靶点的时候,它从来没有被验证过,这里边最大的失败可能并不是你找不到一个好的化合物和它相互作用,而是作用之后到底对疾病或者生物机制有没有显著的影响。因为我们知道某一个疾病虽然有一个靶点会影响他,可能还有别的通路或者靶点影响,药物失败有百分之八九十是因为这个原因造成的。所以它的成药性本身我自己觉得可能是更本质或者更挑战的问题,如果想找一个活性的化合物,反而可能是技术上差不多能达到的事情。
评论(0
登录后参与评论
    相关问答