DNA、底盘细胞、菌株这些底层工具的概念

菌株底盘细胞
王波 2022-12-30
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康康
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DNA对于我们上游的研发企业来说是非常重要的原料,对于已经孵化到产业价值实际菌株和菌株培养基就够了,不需要再用DNA。DNA是我们的原料,我们做研发的时候要用海量的DNA来做模块的构建测试,尤其像我们构建ArchiCel这么庞大的工程,我们会够很多的模块,做海量的测试。
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底盘细胞的概念:
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所谓的底盘细胞就是我需要微生物来帮我生产一个东西,为了让它实现我想要的功能,我要用一个微生物来改造。初始的微生物,我们一般称为底盘细胞。
 
一种底盘细胞选用的就是有特定工业价值的天然微生物,尤其是离我的目标产物特别近的天然微生物。比如我要做谷氨酸的衍生物,我肯定用的是谷氨酸棒状杆菌,那它就是底盘生物。另一种底层细胞是模式微生物,如果我做一个很新的药物分子,自然界中可能没有特别合适的天然微生物,我很有可能会用模式菌株。比如这个时候我会用酿酒酵母来做我的底盘生物,在它的代谢网络基础上,做特定的代谢通路的构建和修建。
 
我们做的ArchiCel,理论上希望它成为一种泛用型的底盘生物。即并不是一个底盘生物,我们向大家提供1000种或者1万种ArchiCel,它就是1000种或者1万种的底盘生物,每一种和每一种都不太一样,因为它的代谢网络属性并不一样。比如这个版本的ArchiCel,它可能就是甘氨酸产量特别多,如果你想研究甘氨酸下游能有什么产物,就可以选用这一株ArchiCel 作为底盘生物。如果你想专门产萜类物质,我们也可能会推出一株高产法尼烯的ArchiCel ,它就会成为你新应用的研发起点,它就会成为你的地盘生物。
 
实际上,我们最终希望提供的就是这样的一套服务,我们给大家上千株可选的底盘生物,而且这一套生物是有同样的架构,同样的逻辑,同样的数据库,同样的开发工具集,这样大家就不需要从自然界中选那些特别难改、特别难用的天然微生物,或者离你目标特别远的工程菌株。不再使用这一系列底盘生物,而使用像我们这样成套的底盘生物。

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