一个是 AI 跟基因治疗的一个结合,对它的未来这块你是怎么样去看的?另外一个对于个其它人要做这个 AI 这一块要加基因治疗的这种,尤其像你这边做的是AAV也好,你有什么样的具体的其它的建议?

AI新药开发AI技术
王波 2022-12-08
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韩蓝青
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那么这个基因治疗首先我们要去了解它的这个基因治疗这个靶点到底是什么,这个基因治疗我认为将来很可能会像一个性化的治疗去发展,因为我们就是这个基因病,尤其是我们说的罕见病。为什么说罕见病因为就是一些这个散发的单基因的突变造成的这些疾病,那么它它分布在这个 23 对染色的可以是任何的地方,所以说它每一种突变可能它这个病人的人数不一定特别多,但是它总的加起来了,据说在全球也有 3 亿人,是一个非常大庞大的一个病人团体。
 
那么就是某一个基因病,比如说就像这个 dmd ,Dystrophy这条基因它也是人类的一个最大的一条基因,那么我们已知的这个能够造成 dmd 或者 bmb 的这个致病突变了,就不下 3000 个,那么我们未知的或者说我们的数据库里面还没有收入的,那可能会更多,所以第一步我们要去确定到底哪一个是致病突变,那么我们不管是用这个基因编辑或者是用这个AV带进去一个这个能够解决这个 loss function 的问题的表达蛋白的 DNA ,或者说是用这个小核酸来进行干预,首先你要知道这个突变点制定的突变点在哪,所以这个我们在源头上面,我在清华珠三角研究院,我们一个团队正在做算是一个比较大型的综合性的罕见病基因治疗的一个数据库,那么这个数据库它分三个大的板块基因疾病,还有模型,可以是细胞模型,可以是这个小动物模型,那么我们这个数据库有别于这个 ncbi 或者是其它的这些西方的一些大型数据库,我们最大的特点是我们布置了各种各样的我们训练好的 AI 模型。
 
目前我们马上要上线了这个数据库,目前我们第一步先上的两个 AI 模型,一个是去做这个未知的、突变的这个致病风险的评估;然后另外一件事情就是我去在给你做一个MRNA剪接的预测,为什么要做这个事情呢?实际上现在我们看了很多的市面上的这些第三方的检测机构,说这二代测序以后,拿了报告以后发现了很多突变,到底哪一个是治病突变?实际上很多报告它是没有能力告诉你的,假如说我们在西方的这些数据库里面已经出现过了,它可能可以告诉你,但是对于那种没有定论的、这个没有被收录的这些突变,往往是原因不明。那我们想这是个行业痛点,我们先要找到这个病因在哪,这个时候我们的 AI 在这里面起到了一个非常大的作用。最近我们是在跟一些罕见病人的团体在做这个对接,我们去一个一个的、我们试图去把以前说它这个检测序报告已经在那了,但是这里面还不能给它一个非常明确的这个答案,说到底哪一个是致病突变,现在我们的模型可以至少是缩小范围,至少是能够告诉它,你最有可能、是哪一个突变造成了你的问题。
 
另外一个就是在最近这几年,我们觉得以前被大家忽视的一个致病的原因,就是MRNA的剪接的问题,以前这是经常是被忽视的。实际上我们以前最关心的就是蛋白翻译的这些序列,但实际上有很多是调控序列上面的突变出了问题,有很多不一定是在 exon 上面,也许是在 introne上面出的问题,我们的这个MRNA剪接的这个模型就能告诉你这个突变是不是造成了MRNA剪接的错误剪接。我们现在估计是在 20% 和 30% 的突变是造成了 MRNA剪接的这个错误,这是我们的第一步,基因治疗我们要先去知道到底这个致病突变在哪,我们在这上面也是做了很多的工作,我认为未来的基因治疗一定是一个性化的基因治疗,也许全世界我们只知道是有一个病人是这种突变,那我们可能就针对它来设计一个干预的办法,那就有可能是基因编辑,有可能是比如说是这个反义寡核苷酸,我们可以专门为它设计。
 
那么我觉得假如说想进入这个领域,首先要去把这个问题搞清楚,这个基因治疗你的这个作用靶点到底是不是真正的作用靶点。刚才我看有问题在问,有没有这个 dmb 的小鼠模型?这个模型我们是有的,但是目前 dmd 批的药,还有在临床试验阶段的药,现在有好几款。那么这个时候你对小鼠模型,可能是不同的突变需要不同的小鼠模型,我们也考虑过把这个 dmd 这条线全部的人源化,但这个线实在太大了,所以说你要需要 dmd 这个小鼠模型的话,首先我们要问你要解决什么问题?就是你的致病突变在什么地方,我们会对症下药的去给你提供这样的小鼠模型。

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