您提到的数字病人是怎么做的?在哪个层次做的模型?这个模型用了什么数学方法?

数字模型
王波 2023-11-24
分享
赵宇
103
从二三年前在大家做1%人基因组草图的时候,整个数据处理,包括拼接的技术,从这就开始做,几代人做了这么一件事,包括我们提到整个数字建模的时候,我们可能是全球唯一能将基因组学数据映射到信号通路的团队,当大家都是在做用GWAS全基因组关联,希望能够将组学数据直接映射到表型数据的时候,我们就构建了信号通路,所以我们现在大概构建了几千条信号通路。
 
那这时候,当我们看待一个疾病的时候,我们不是用全基因组关联拿一堆队列看他们中间统计里面他们这个方法,而是我们把它构建成了每一个人,就像雷达图一样,高高低低的,可能几十个、上百个基因的构建了一条信号通路的活性评价。
 
以乳腺癌为例,我们乳腺癌做得很早了,因为当时算力还是不够。如果我们现在重新算的话,我们大概是3000多个基因动用了60多条信号通路,3000多个基因评价的乳腺癌。BRCA1/2基因在病人人群当中也就百分之三点几,健康人群百分之为零点几的程度,大部分都解释不了。而我们构建完这个模型的时候,我们把整个BRCA1/2基因抽掉,它对模型丝毫没有影响,而且构建完这个模型是个指数型关系,以这些是很多工作的积累。
评论(0
登录后参与评论
    相关问答